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发布日期：2024-08-01 作者：开云
5月17日，中国科学院生物物理研究所方显杨研究组与动物研究所李幸研究组合作在《天然-通信》上颁发研究论文，揭露荧光点亮RNA适配体RhoBAST连系与激活荧光团TMR-DN的机制，为理性设计和优化这一主要的FLAP系统供给了机制看法。
在活细胞中对生物年夜份子如卵白质和RNA等进行时空定位和追踪，对理解它们的生物学功能和揭露其机制相当主要。今朝，荧光点亮RNA适配体(FLAP)被认为是强有力的活细胞RNA荧光成像东西。此中，RhoBAST是一种表示优良开云体育app的FLAP成像东西，可以连系并激活一种接触淬灭型罗丹明衍生物TMR-DN，并在RNA的超分辩率成像中表示出优良的机能，但其连系和激活荧光染料的布局机制还不清晰。
研究人员起首利用X射线晶体学解析了RhoBAST与TMR-DN复合物的高分辩率布局，发现RhoBAST折叠成一种四分支布局，整体布局近似在不合错误称的“A”字形。研究发现，RhoBAST的布局刚性和半开放的布局口袋的特点可能还付与它与配体快速互换的动力学机能，其要比其它FLAP如pepper系统最少快两个数目级以上，是以可以经由过程与溶液中新颖配体的快速互换来很好地避免光漂白问题，使其在荧光超分辩成像揭示出良好的光学性质。
为了更好理解RhoBAST对TMR-DN的激活机制，研究人员采取加强采样的份子动力学摹拟方式表征了TMR-DN在自由态和与RhoBAST连系状况下的构象空间。成果注解，不管是自由仍是连系状况下，TMR-DN都显现出一种高度动态的构象特点，此中接触-非堆叠构象占有所有接触类型中的大都。
相干论文信息：
https://doi.org/10.1038/s41467-024-48478-9
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